Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMCQ9BYG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMCQ9BYG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMCQ9BYG8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms