Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC3Q9BY71 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC3Q9BY71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC3Q9BY71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC3Q9BY71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms