Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF1Q9BQI6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLF1Q9BQI6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF1Q9BQI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms