Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rtn4Q99P72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rtn4Q99P72 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms