Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BrapQ99MP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BrapQ99MP8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms