Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Erc1Q99MI1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Erc1Q99MI1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Erc1Q99MI1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 620.8 ms