Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SardhQ99LB7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SardhQ99LB7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SardhQ99LB7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SardhQ99LB7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SardhQ99LB7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms