Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf34Q99KR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf34Q99KR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.3 ms