Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nxf1Q99JX7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nxf1Q99JX7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nxf1Q99JX7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms