Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Krcc1Q99JT5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krcc1Q99JT5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krcc1Q99JT5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms