Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ophn1Q99J31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ophn1Q99J31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms