Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln1Q99J21 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln1Q99J21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln1Q99J21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms