Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRG3Q99928 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRG3Q99928 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296 ms