Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD9AQ99638 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms