Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNQ99608 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNQ99608 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNQ99608 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNQ99608 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNQ99608 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNQ99608 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNQ99608 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNQ99608 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNQ99608 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNQ99608 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNQ99608 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNQ99608 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNQ99608 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNQ99608 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNQ99608 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNQ99608 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNQ99608 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms