Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNL2Q96S94 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL2Q96S94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms