Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPRD1AQ96P16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1AQ96P16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPRD1AQ96P16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms