Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD4Q96M96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD4Q96M96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD4Q96M96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms