Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF19Q96DZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF19Q96DZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF19Q96DZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms