Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Xrcc4Q924T3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrcc4Q924T3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms