Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfcdQ922L6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NelfcdQ922L6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfcdQ922L6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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