Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Synpo2Q91YE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms