Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm4sf4Q91XD3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm4sf4Q91XD3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm4sf4Q91XD3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm4sf4Q91XD3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms