Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usb1Q91W78 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usb1Q91W78 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usb1Q91W78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 789.7 ms