Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3Q8WWT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms