Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC4Q8WW27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC4Q8WW27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APOBEC4Q8WW27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms