Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg8Q8VE18 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg8Q8VE18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg8Q8VE18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms