Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ParnQ8VDG3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ParnQ8VDG3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParnQ8VDG3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ParnQ8VDG3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms