Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpap2Q8VC34 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpap2Q8VC34 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms