Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTRT2Q8TDY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTRT2Q8TDY3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms