Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCOLN3Q8TDD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3Q8TDD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms