Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3L4Q8TBR4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3L4Q8TBR4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms