Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk8Q8R3L8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk8Q8R3L8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk8Q8R3L8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms