Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brd3Q8K2F0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms