Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pop1Q8K205 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pop1Q8K205 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pop1Q8K205 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms