Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC65Q8IXS2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC65Q8IXS2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC65Q8IXS2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms