Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARP9Q8IXQ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP9Q8IXQ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms