Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFTPA2Q8IWL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFTPA2Q8IWL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPA2Q8IWL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms