Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam228aQ8CDW1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam228aQ8CDW1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam228aQ8CDW1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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