Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phf20l1Q8CCJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Phf20l1Q8CCJ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phf20l1Q8CCJ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms