Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Strip2Q8C9H6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Strip2Q8C9H6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Strip2Q8C9H6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms