Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsr2Q8C8T8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr2Q8C8T8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr2Q8C8T8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr2Q8C8T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms