Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClmnQ8C5W0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClmnQ8C5W0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms