Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cwc22Q8C5N3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cwc22Q8C5N3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms