Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmo3Q8BZL8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmo3Q8BZL8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmo3Q8BZL8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms