Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl3Q8BVF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdcl3Q8BVF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdcl3Q8BVF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms