Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik4Q8BMF5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik4Q8BMF5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grik4Q8BMF5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms