Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem260Q8BMD6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem260Q8BMD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem260Q8BMD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem260Q8BMD6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem260Q8BMD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem260Q8BMD6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem260Q8BMD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms