Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnrc6bQ8BKI2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnrc6bQ8BKI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.9 ms