Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg4dQ8BGV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg4dQ8BGV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms